Pratique du Shadowing: High Resolution Melting (HRM) analysis made easy. - Apprendre l'anglais à l'oral avec la vidéo

Création de la leçon...
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High resolution melting
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or HRM is a very sensitive method to detect sequence variation
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in different samples up to a resolution of a single base pair without the need of sequencing.
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Here you see a wild type of DNA or a PCR product.
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After mutation you may get a homozygous mutant in
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which both the alleles are mutated or a heterozygous mutant in which a single allele is mutated.
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Now you want to check if mutation is there or not.
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HRM is based upon the principle of DNA dissociation with increase in temperature followed by detection by a fluorescent dye.
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The DNA denituration is based on the GC content.
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Higher the GC content, stronger will be the DNA bonds and higher will be the melting temperature to dissociate the two strands.
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In HRM, the detection is assisted by specific binding of a saturating fluorescent dye to the double-stranded DNA
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and measuring its fluorescence in real time on increasing the temperature gradually.
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For HRM, you need to PCR amplify your target gene locus to obtain a specific amplicon.
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Smaller the size of amplicon, better the results will be.
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Then you add a saturating fluorescent dye
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that binds to the dna only in the double stranded form
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then you proceed for hrm analysis in a real time machine here you gradually increase the temperature
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and fluorescence is measured simultaneously the plot shows fluorescence in the y-axis and temperature on the x-axis
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3 different curves are obtained for wild, homozygous and heterozygous mutant.
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Here you see as homozygous mutant had a GC mutation as seen in the previous slide its TM is higher.
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So the curve shifts towards the right.
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Heterozygous mutant on the other hand have a mutation in only one strand.
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So it has a base mismatch and hence the TM is reduced and the curve shifts towards the left.
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method is so sensitive that it detects the variation in the melting temperature up to 0.2 degree Celsius.
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HRM being a simple, economic, rapid and precise method of DNA variant detection, it can be used for mutant identification,
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SNP genotyping, DNA methylation by bisulfide sequencing, DNA fingerprinting and so on.
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This video has been made on a special request by Ms. Sahily Russell.

Vocabulaire et conseils d’expression pour cette leçon

Cette vidéo contient 27 phrases et 373 mots à répéter en shadowing. La partie parlée dure 2:30. Le locuteur parle à un rythme régulier d’environ 149 mots par minute, confortable pour le shadowing. Seuls 66 % des mots font partie des 3 000 mots les plus courants en anglais, le vocabulaire est donc exigeant.

Vocabulaire clé de cette vidéo

15 mots de la vidéo à retenir, avec leur prononciation et leur sens :

MotPrononciationSens
mutant nom/ˈmju(t)n̩(t)/mutant
strand nom/ˈstɹænd/brin, toron
mutation nom/mjuˈteɪʃən/mutation
sequence nom/ˈsiː.kwəns/suite, séquence
curve nom/kɚv/courbe
detection nom/dɪˈtɛk.ʃən/détection
melt verbe/mɛlt/fondre, se dissoudre
sensitive adjectif/ˈsɛn.sɪt.ɪv/sensible
obtain verbe/əbˈteɪn/obtenir, se procurer
variation nom/ˌvɛəɹiˈeɪʃn̩/variation
detect verbe/dɪˈtɛkt/déceler, détecter
axis nom/ˈæksɪs/axe
assist verbe/əˈsɪst/assister, aider
hence adverbe/ˈhɛns/d'ici
rapid adjectif/ˈɹæp.ɪd/rapide

Prononciation à surveiller

  • Les sons « sh » et « zh »: mutation /mjuˈteɪʃən/, detection /dɪˈtɛk.ʃən/, variation /ˌvɛəɹiˈeɪʃn̩/, identification /aɪˌdɛn(t)ɪfɪˈkeɪʃn̩/, dissociate /dɪˈsoʊ.ʃi.eɪt/
  • Mots longs — placez bien l’accent: identification /aɪˌdɛn(t)ɪfɪˈkeɪʃn̩/, simultaneously /ˌsaɪmlˈteɪnɪəsli/, homozygous /ˌhəʊməʊˈzaɪɡəs/, dissociate /dɪˈsoʊ.ʃi.eɪt/, dissociation /dɪˌsoʊsiˈeɪʃən/

Comment s’entraîner avec cette vidéo

  1. Écoutez la vidéo en entier une fois sans parler et notez les mots que vous ne connaissez pas.
  2. Répétez phrase par phrase à vitesse normale, en reprenant chacune jusqu’à ce que votre rythme corresponde à celui du locuteur.
  3. Enregistrez-vous et comparez avec l’original, en faisant attention à des mots comme mutant, strand, mutation.

Qu'est-ce que la technique du Shadowing ?

Le Shadowing est une technique d'apprentissage des langues fondée sur la science, développée à l'origine pour la formation des interprètes professionnels. Le principe est simple mais puissant : vous écoutez de l'anglais natif et le répétez immédiatement à voix haute — comme une ombre suivant le locuteur avec un décalage de 1 à 2 secondes. Les recherches montrent une amélioration significative de la précision de la prononciation, de l'intonation, du rythme, des liaisons, de la compréhension orale et de la fluidité.

Technique du shadowing : lire le guide complet étape par étape →